Tutti i pinguini sono ex ospiti dello zoo di Central Park. Si comportano come dei soldati e ogni loro azione è paragonabile ad una missione militare, e usano anche il linguaggio da soldati come “mi serve fuoco di copertura”, si rivelano quindi molto efficienti, organizzati, scaltri e spietati ma anche buffi. Nel secondo film con i pinguini riusciranno anche ad aggiustare un aereo che li riporterà a New York. Insieme sono protagonisti di un cortometraggio Pinguini di Madagascar in Missione Natale, e anche di un “spin-off” a cartoni animati tutto per loro. Riescono a resistere al caldo ed il loro pezzo di ghiaccio nel loro recinto di zoo è anche una sede sotterranea per ragionare insieme.
Skipper: il comandante dei pinguini, il leader del gruppo. Autoritario e a volte severo, ma sempre pronto a sentire l’opinione dei compagni, mantenendo comunque la disciplina nel gruppo. Nel secondo film si innamorerà e si sposerà con una bambola rappresentante una ballerina di hula trovata nell’aeroplano dei lemuri. Doppiato in originale da Tom McGrath ed in italiano da Luigi Ferraro.
Kowalski: il più alto e intelligente di tutti, è lui che prepara tutti i piani d’azione, prende appunti per Skipper e analizza ogni situazione nel minimo dettaglio. Doppiato da Chris Miller (Madagascar 1, 2, 3, 4 e Merry Madagascar) e Jeff Bennett ed in italiano da Gerolamo Alchieri.
Soldato (Private nella versione originale): il più piccolo dei pinguini, distinguibile per i suoi occhi più tondi e innocenti e per essere il più basso di tutti. Soldato è il più amoroso e gentile del gruppo ma meno considerato in quanto non possiede una sua specialità ed è anche sfortunato, comunque è il tuttofare di Skipper. Doppiato in originale da Christopher Knights (Madagascar 1, 2, 3, 4 e Merry Madagascar) e James Patrick Stuart (I pinguini di Madagascar) e in italiano da Franco Mannella.
Rico: è il braccio destro di Skipper. La sua ottima preparazione con i coltelli, arti marziali e dinamite lo rendono un ottimo combattente, non raramente, estremo. Rico comprende chiaramente, ma non parla la lingua degli altri pinguini, anche se ogni tanto mima qualche parolina (soprattutto “kaboom”). Ha sempre tutto quello che serve (Skipper chiede una cosa e Rico la rigurgita fuori). Ha una vistosa cicatrice sulla guancia sinistra. Doppiato da John DiMaggio e in italiano da Pasquale Anselmo.
